一般準(zhǔn)備幾個氣相色譜柱就基本可以解決各類氣相色譜分析工作的要求，可優(yōu)先選擇固定液分別為SE-30（或者OV-101）、OV-17、PEG-20M、DEGS、FFAP的柱子各一個。對于填充柱，擔(dān)體可選白色擔(dān)體、紅色擔(dān)體（包括未酸洗、酸洗、硅烷化）、GDX系列（或者Porapak系列）三種，基本可以解決工作中絕大部分項目。氣相色譜常用的載氣是：氫氣、氮?dú)?、氬氣、氦氣?
對柱子長短的選擇：由于分辨率與柱長的平方根成正比。柱子長，則提高分辨率。一般來說：15m的短柱用于快速分離較簡單的樣品，也適于快速成分掃描分析;30m的色譜柱是常用的柱長，大多數(shù)分析在此長度的柱子上完成;50m、60m或更長的氣相色譜柱/氣象色譜柱用于分離比較復(fù)雜的樣品。
對于口徑的選擇：柱徑直接影響柱子的效率、保留特性和樣品容量。小口徑柱比大口徑柱有更高柱效，但柱容量更小。
0.25mm：具有較高的柱效，柱容量較低。分離復(fù)雜樣品較好。
0.32mm：柱效稍低于0.25mm的色譜柱，但柱容量約高60%。
0.53mm：具有類似于填充柱的柱容量，可用于分流進(jìn)樣，也可用于不分流進(jìn)樣，當(dāng)柱容量是主要考慮因素時（如痕量分析），選擇大口徑毛細(xì)管柱較為合適。專家認(rèn)為，對于普通用戶，可選30米或50米長的毛細(xì)管，口徑選0.32mm較為便利。